苹果MdPIF4基因克隆、表达与功能验证

来源 :分子植物育种 | 被引量 : 0次 | 上传用户:chenken2725115
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
温度是影响植物生长发育重要的环境因子之一,光敏色素互作因子PIF4是植物响应温和高温的核心基因,明确MdPIF4在苹果温度响应中的作用具有重要意义.本研究克隆了MdPIF4的编码区和启动子序列,分析了MdPIF4的表达情况,对MdPIF4转录激活活性进行了分析和互作蛋白筛选,并在野生型拟南芥中异源过表达了MdPIF4.结果 显示:MdPIF4基因编码区包含1656 bp的核苷酸,编码551个氨基酸,预测其蛋白质分子质量为60670.87 Da,等电点为6.63.MdPIF4在苹果叶片中的表达量最高,其次为根、茎、花,在果实中的表达量最低.MdPIF4启动子中含有光响应元件、ABA(脱落酸)响应元件ABRE、SA(水杨酸)响应元件TCA-element、厌氧调节响应元件ARE、干旱响应元件MBS等.MdPIF4受温和高温诱导表达.不同物种间bHLH结构域的蛋白序列保守性较强,MdPIF4序列全长在酵母中具有转录自激活活性,bHLH结构域在酵母中没有自激活活性,其余片段均具有自激活活性.以bHLH结构域为诱饵蛋白,酵母双杂交筛库获得3个互作蛋白,分别为MdWRKY70、MdHAT5和MdRab11D.在野生型拟南芥中过表达MdPIF4促进了拟南芥幼苗下胚轴的生长.上述研究表明MdPIF4参与苹果温和高温响应.
其他文献
本研究以高糖甜菜品种\'BS02\'为材料,采用同源克隆技术分离其液泡膜Na+/H+逆向转运蛋白基因,命名为BvNHX1.该基因包含有1 659 bp的开放阅读框,编码552个氨基酸,蛋白分子量为61.31 kD,理论等电点为6.31.预测该基因编码的蛋白具有12个跨膜结构域,同时具有Nhap、Na_H_Exchanger和b_cpa1超家族的保守结构域,而且与盐角草、犁苞滨藜、盐地碱蓬等多种藜科植物NHXs聚为一类,属于液泡膜NHX家族中的Class Ⅰ成员.实时荧光定量PCR结果显示:在400
为探讨过氧化氢酶(Catalase,CAT)在藜麦基因组中的结构和表达特点,分析CAT在藜麦耐受逆境胁迫机制中的作用,本研究从藜麦基因组中鉴定出4个可分为2个亚组的CAT基因家族成员.系统进化树显示藜麦CqCAT基因家族成员的基本特征在单双子叶植物分离之前就已形成.该家族成员的二级结构主要特点为:由α-螺旋和无规则卷曲组成;含20种以上氨基酸,存在10种不同的保守基序.基因启动子区域共预测到响应脱落酸、茉莉酸、水杨酸、低温和干旱等11种相关的顺式作用元件.RNA-seq分析表明该家族成员具有组织特异性表达
为研究马铃薯冷驯化机理,通过同位素相对标记与绝对定量技术(isobaric tags for relative and abso-lute quantification,iTRAQ)分析了冷驯化过程中(0,4和12 d)马铃薯野生种Solaum acaule (W3,具备冷驯化能力)和S.cardiophyllum (Cph12,无冷驯化能力)的蛋白质组变化.结果 表明,在W3和Cph12中筛选的可信蛋白质数量分别为2126和1044;在冷驯化早期分别筛选到103与56个差异表达蛋白,后期分别筛选到330
羟甲基戊二酰辅酶A还原酶(HMGR)是甲羟戊酸(MVA)途径的第一个限速酶.为了探索HMGR家族基因在芒果中的作用,本研究鉴定了芒果HMGR家族基因,并对HMGR家族基因的理化性质、系统发育及在芒果中的表达量进行了分析.结果显示,芒果HMGR家族蛋白序列均包含完整的HMG-CoA_red结构域,且HMGR家族蛋白均为疏水性蛋白.系统发育树显示,HMGR家族基因是从苔藓植物开始形成的,且芒果HMGR家族基因均聚在双子叶植物的分支,与物种进化历程一致.HMGR家族基因在芒果品种\'贵妃\'和\'台
生长素在植物生长发育过程中具有多方面的调控作用,生长素受体是生长素信号分子通路的关键组分之一,但目前对大白菜中生长素受体基因相关研究未见报道.本研究在白菜基因组中共鉴定到10个TIR1/AFB(Transport inhibitor response 1/auxin signaling F-box protein)生长素受体基因家族成员,在系统进化树上可聚类为6个分支,并依据其与拟南芥TIR1/AFB家族基因的系统发育进化关系命名为BrTIR1/AFBs.基因染色体定位分析结果表明,这10个BrTIR1/
参薯(Dioscorea alata)在热带和亚热带广泛种植,为该地区的人提供了粮食,具有重要的经济价值.miR156及其靶基因SPL对植物的生长发育的调控起到重要的作用,为了分析参薯中miR156-SPL的调控模块,本研究对参薯miR156基因位点和对应靶基因进行预测和验证.基于参薯基因组以及转录组信息,一共得到DamiR156的8个基因位点,预测了miR156的6个靶基因,其中4个属于SPL基因家族.多序列比对分析发现8个Da-miR156的前体序列在发卡区高度保守,根据序列同源性可以分为3组.表达谱
为了解决东方百合花型单一、花粉量大、污染花瓣影响美观以及引起部分人群花粉过敏等问题,本研究以东方百合\'Siberia\'为材料,提取其雌蕊总RNA,通过RT-PCR方法克隆得到2个cDNA片段,其全长分别为795bp和678bp,分别编码264aa和225aa,GC含量分别为46.7%和43.2%,这两个基因片段与其他百合属AG基因同源性分别在85%和70%以上,且发现两个蛋白均属于碱性不稳定疏水蛋白.此外,2个基因均具有保守的MADS-box区、K区及典型的AG Ⅰ和AGⅡ区,进一步说明2个基
本研究利用同源克隆方法从黄瓜(Cucumis sativus L.)顶芽中克隆获得APETALA2 (AP2)同源基因CsAP2的cDNA序列.序列分析表明,CsAP2基因cDNA序列的完整开放阅读框(ORF)为1452 bp,编码483个氨基酸,其分子质量为53359,理论等电点为5.59.多序列比对和系统进化分析表明,CsAP2位于A类基因AP2分支,包含两个保守的AP2结构域.CsAP2与甜瓜CmAP2的同源性最高,为97.7%.CsAP2定位在细胞核.实时荧光定量PCR显示,CsAP2基因在营养器
本研究为揭示软枣猕猴桃中无色花色素双加氧酶(leucoanthocyanidin dioxygenase,LDOX)基因结构及其功能.运用生物信息学方法对软枣猕猴桃LDOX核苷酸及氨基酸序列进行深入分析,构建LDOX基因的蛋白互作网络,并进行GO及KEGG功能注释分析.结果显示:软枣猕猴桃与野茶树、以南高丛蓝莓、蓝莓、金银花及胡萝 卜亲缘关系较近,含有10个保守基序.顺式调控元件主要参与ABA信号途径、响应干旱应答,厌氧诱导、赤霉素、生长素响应因子、MeJA反应、低温响应、光刺激应答响应元件.LDOX理化
GRF (Growth-regulating factor)基因家族是一种广泛分布于种子植物的转录因子,在调节植物的生长、发育中发挥重要的作用.本研究从葡萄基因组鉴定出8个VvGRF基因,命名为VvGRF1~VvGRF8.采用生物信息学的方法,系统地对葡萄VvGRF家族的蛋白理化性质、进化关系、保守基序及在不同发育时期的差异性表达进行预测和分析.结果 表明,VvGRF基因内含子与外显子数量差异较小,在所有预测蛋白的N端含有两个典型的保守结构域QLQ与WRC;系统进化分析将GRF家族成员分为6组,其中葡萄与