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大学中的学术自治与科层制是一对无法完全消解的矛盾。在现代条件下,这对矛盾还展现出日益尖锐化的趋势。在当代社会和科技迅速发展的背景下,双方制衡之道在于深刻认识大学的本质和功能;正确理解大学学术自治和科层制的涵义及实质;扩大学者的自由空间,减少不必要的规制;改善大学行政的运行体制机制,增强大学服务社会和国家现实需求的能力等。