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食管疾病的临床诊断主要依靠准确的病史；体格检查一般没有帮助。伴有疼痛的通过紊乱症状(吞咽困难，反流)是食管疾病的典型表现。单独的疼痛或胸部不适(包括胸骨后烧灼感)对食管疾病没有特异性，可以发生在从心绞痛到胸壁疾病、肺部疾病及腹腔内疾病各种情况。通过紊乱的症状对食管疾病更具特异性，并见于食管运动失调以及结构性异常(例如炎症或肿瘤性疾病)病人。