重庆两株H5N1流感病毒的HA、NA基因克隆及序列分析

• 作 者: 胡仁建 顾盼 蔡家利 刘海军 丁森 张奎 李重阳 陈华 王冬梅
• 机 构: 重庆理工大学药学与生物工程学院,西南大学家蚕基因组生物学国家重点实验室,重庆市公安局,南京大学,珠海联邦制药有限公司,中国农业大学,
• 出 处: 重庆理工大学学报(自然科学)
• 发表日期: 2017年01期
• 关键词: 禽流感病毒 H5N1 基因克隆 序列分析 进化分析

2012年,从重庆北碚区和巴南区的家禽养殖场死鸭和病鸡体内分离出两株H5N1禽流感病毒,分别命名为A/duck/Chongqing/BB/H5N1和A/chicken/Chongqing/BN/H5N1,并对这两株H5N1禽流感病毒的HA、NA和M蛋白的基因进行了克隆及序列分析,在基因和蛋白质水平上分析其同源性。遗传进化树分析结果表明:这两毒株的HA、NA和M基因不处于同一支上,亲缘关系较远;这两毒株的HA、NA、M蛋白的基因同源性分别达95%,95%,97%;两毒株的HA蛋白裂解位点氨基酸序列均为RERRR-KR,符合高致病性禽流感的特征。本次分离的流感病毒的基因克隆鉴定和序列分析为禽流感的流行病学研究、疫苗研制以及防控提供重要理论依据。