SARS病毒基因组所编码的E蛋白的二级结构和B细胞表位预测

• 作 者: 吕燕波 万瑛 吴玉章
• 机 构: 第三军医大学免疫学教研室
• 出 处: 免疫学杂志
• 发表日期: 2003年6期
• 关键词: SARS病毒 E蛋白 B细胞表位 二级结构 预测

目的预测SARS病毒E蛋白的B细胞表位和二级结构.方法以SARS病毒基因组序列为基础,采用Gar-nier-Robson方法、Chou-Fasman方法和Karplus-Schultz方法预测E蛋白质的二级结构;用Kyte-Doolittle方案预测蛋白质的亲水性;用Emini方案预测蛋白质的表面可能性;用Jmeson-Wolf方案预测氨基酸的抗原性指数.综合评判,预测SARS病毒E蛋白的B细胞表位.结果在SARS病毒E蛋白N-端的第1～6、13～19、39～43、47～64区段和第73～76区段有β-折