一株肠道病毒71型广西分离株全基因序列分析

• 作 者: 闭福银 谢镇国 陈敏玫 周开娇 康宁 居昱 莫兆军 谭毅
• 机 构: 广西壮族自治区疾病预防控制中心
• 出 处: 应用预防医学
• 发表日期: 2011年5期
• 关键词: 肠道病毒 EV71 全基因组 序列分析 Enterovirus EV71 Genome Sequence analysis

目的了解肠道病毒71型CZ01株的全基因组分子特征。方法应用覆盖病毒全基因组的15对特异性引物对毒株进行RT—PCR扩增，PCR产物直接测序，拼接后得到全基因序列，应用Clustal X（1．81、DNASTAR、Mega4．1等生物软件进行核苷酸序列及氨基酸序列分析和病毒的系统进化分析。结果CZ01株病毒全基因组核苷酸序列长度为7406bp，与中国大陆北京毒株BJ08-Z011-4和安徽阜阳毒株Fuyang.Anhui／17．08／2整个基因组核苷酸同源性为98．8％和98．5％，氨基酸同源性分别为99