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种子行政许可制度包括种子经营许可、种子生产许可两项制度,我国现行种子行政许可在审核发放过程中存在控质不控量、重"硬件"轻"软件"、级别设置过繁、阻碍企业实际生产等问题,种子行政许可要正本清源,要取消分级种子经营许可制度,取消除转基因以外的农作物种子生产许可制度,提高企业准入门槛,抬升种业协会在"两证"管理中的地位和作用。