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毛乌素沙地柠条群体是一个杂种带，为了进一步阐明分子变异和基因流与生境或生态过渡带的联系，应用ＲＡＰＤ标记开展了柠条群体的分子生态学研究。根据ＲＡＰＤ数据利用Ｓｈａｎｎｏｎ信息指数估计了６个柠条群体的遗传多样性，发现大部分的分子变异存在于柠条群体之内（８２．４％），只有少部分的分子变异存在于群体之间（１７．６％），又利用ｅｉ指数统计了ＲＡＰＤ数据，也证实了大部分的遗传变异存在于群体之间，柠条锦鸡儿群