【摘 要】
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本文利用“禁忌搜索”算法和Ｇｅｈｌｈａａｒ简化能量势函数实现蛋白质与类药分子之间的柔性对接。对包含１００个复合物的检验集进行了计算检验，得到了满意的结果，８９％预测复合物结构的误差小于０．２５ｎｍ。与利用
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本文利用“禁忌搜索”算法和Ｇｅｈｌｈａａｒ简化能量势函数实现蛋白质与类药分子之间的柔性对接。对包含１００个复合物的检验集进行了计算检验，得到了满意的结果，８９％预测复合物结构的误差小于０．２５ｎｍ。与利用遗传算法进行柔性对接的ＧＯＬＤ程序相比，本方法的成功率高，局限性小，计算时间也短。
In this paper, we use “tabu search” algorithm and Gehlhaar simplified energy potential function to realize the flexible docking between protein and drug-like molecules. The test set containing 100 complexes was tested and the results were satisfactory. The error of 89% predicted complex structure was less than 0.25 nm. Compared with GOLD program, which uses flexible genetic algorithm, the method has high success rate, small limitation and short calculation time.
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