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番茄晚疫病菌是一种寄生性较强的病原真菌，分离纯化难度较大。采用选择性培养基（黑麦粉５０ｇ，琼脂１５ｇ，水１０００ｍｌ，灭菌后加入利福平２０ｍｇ，氨卞青霉素２００ｍｇ和７０％五氯硝基苯１００ｍｇ），选择刚发病的症状典型的病叶，在显微镜下挑取晚疫病菌菌丝顶端，移植到平板上培养，待菌丝呈放射性生长２～３ｄ后，再将菌落边缘单菌丝的尖端连同培养基切下，置于斜面黑麦基础培养基上，可获得番茄晚疫病菌纯菌种。