【摘 要】
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目的通过RNA-seq分析消癌平作用前后肝癌细胞HepG2的差异表达基因(differentially expressed genes,DEG)及可变剪接(alternative splicing,AS)。方法本研究以HepG2细胞作为对
【机 构】
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华中科技大学同济医学院附属梨园医院肿瘤科,华中科技大学同济医学院附属协和医院肿瘤中心
【基金项目】
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湖北省自然科学基金(2014CFB960)
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目的通过RNA-seq分析消癌平作用前后肝癌细胞HepG2的差异表达基因(differentially expressed genes,DEG)及可变剪接(alternative splicing,AS)。方法本研究以HepG2细胞作为对照组,以质量浓度为40 mg/L消癌平作用24 h后的肝癌细胞为实验组,利用Illumina HiSeq平台对实验组和对照组进行分析,使用PossionDis方法进行DEG检测,使用rMATS软件检测不同样品间的AS和差异剪接基因(differentially splic
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