蓖麻RcNHX2基因克隆与生物信息学分析

• 作 者: 冯紫洲 耿学军 李平 张继星 陈永胜 霍红雁 冀照君 穆莎茉莉 丛娇娇 李惠根
• 机 构: 内蒙古民族大学农学院,内蒙古民族大学生命科学学院,内蒙古自治区高校蓖麻产业工程技术研究中心内蒙古自治区蓖麻育种重点实验室内蒙古自治区蓖麻产业协同创新培育中心,
• 出 处: 分子植物育种
• 发表日期: 2016年11期
• 关键词: 蓖麻 液泡膜型钠氢逆向转运蛋白 基因克隆 生物信息学分析

液泡膜型钠氢逆向转运蛋白（Tonoplast Na⁺/H⁺antiporters,NHX）在植物耐盐方面具有重要意义。本研究利用RACE方法克隆了蓖麻Rc NHX2基因的3’端和5’端片段。最后设计全长引物获得蓖麻Rc NHX2全长序列,并对其进行生物信息学分析。结果表明,蓖麻液泡膜型钠氢逆向转运蛋白基因的c DNA完整的开放阅读框序列为1 626 bp,推测其可编码541个氨基酸;含有典型的液泡膜型钠氢逆向转运蛋白典型的Na⁺/H⁺交换泵(⁵⁰NES⁵²)和氨氯吡嗪咪的结合位点(⁸⁴LFFIYLLPPI⁹³);存在12个跨膜结构域,属于跨膜蛋白;预测其定位于细胞质膜和液泡膜及内质网膜。