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【目的】枯草群芽孢杆菌中枯草芽孢杆菌（Bacillus subtilis）、解淀粉芽孢杆菌（B．amyloliquefaciens）、地衣芽孢杆菌（B．licheniformis）和短小芽孢杆菌（B．pumilus）是微生物肥料中常用菌种，用传统方法鉴定费时费力，有必要建立检测和鉴定这些芽孢杆菌的种特异性PCR方法。【方法】利用已登录的射rA、rpoA和16S rRNA基因序列分别设计和筛选上述菌种的特异引物并建立多重PCR反应体系。【结果】以基因组DNA为模板，扩增芽孢杆菌、类芽孢杆菌和短芽孢杆菌3属1