【摘 要】
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目的 以来自道地药材产区规范化种植基地的巴戟天叶绿体基因组为参考,通过对比不同产地巴戟天叶绿体基因组的碱基变异和遗传距离的差异,探讨巴戟天药材的道地性.方法 利用Illumina Hiseq 2500测序平台进行高通量测序,利用CMA V1.1.1软件进行分析和组装叶绿体基因组,在基因注释的基础上,比对广东、福建、广西和海南不同产地巴戟天叶绿体基因组碱基突变情况和遗传差异情况.结果 与参考基因相比,广东巴戟天群体叶绿体基因组相同,碱基差异数和遗传距离为0;福建巴戟天群体叶绿体基因组碱基差异数为4～16个,
【机 构】
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广州中医药大学,广东广州510006;广东呀依山珍稀药材种植有限公司,广东河源517428
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目的 以来自道地药材产区规范化种植基地的巴戟天叶绿体基因组为参考,通过对比不同产地巴戟天叶绿体基因组的碱基变异和遗传距离的差异,探讨巴戟天药材的道地性.方法 利用Illumina Hiseq 2500测序平台进行高通量测序,利用CMA V1.1.1软件进行分析和组装叶绿体基因组,在基因注释的基础上,比对广东、福建、广西和海南不同产地巴戟天叶绿体基因组碱基突变情况和遗传差异情况.结果 与参考基因相比,广东巴戟天群体叶绿体基因组相同,碱基差异数和遗传距离为0;福建巴戟天群体叶绿体基因组碱基差异数为4～16个,遗传距离为0.026～0.126;广西巴戟天群体和海南巴戟天群体叶绿体基因组差异主要为集中在大单拷贝区的单碱基突变和插入缺失突变,叶绿体基因组碱基差异数为71～81个,遗传距离为0.470～0.536.结论 优良的种质资源是形成道地药材的重要遗传因素,种质资源包含的特定基因是形成道地药材的关键,该研究从基因水平上证明了广东巴戟天种源稳定,广东巴戟天群体叶绿体基因变异少,显示出广东为巴戟天道地产区具有科学性.不同产地的巴戟天叶绿体基因组碱基存在突变差异,这些差异可以为巴戟天的分子标记、遗传背景、种质资源保护及植物系统发育进化等研究奠定基础.
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