基于癌症基因组图谱构建膀胱癌免疫基因预后评估模型

• 作 者: 余鹏 裘硕 杨雨阳 谢德高 高漓 滕若冰
• 机 构: 桂林医学院附属医院泌尿外科,桂林医学院附属医院生殖男科
• 出 处: 解放军医学院学报
• 发表日期: 2020年5期
• 关键词: 膀胱癌 免疫基因 TCGA数据库 评估模型 生物信息学 bladder cancerimmune genesTCGA databaseevaluation mo
• 基金项目: 国家自然科学基金(81660425),桂林市科学研究与技术开发(2016012706-3)

目的采用生物信息学方法,构建膀胱癌患者免疫基因预后评估模型,筛选影响膀胱癌发生及预后的生物标志物。方法下载癌症基因组图谱(The Cancer Genome Atlas,TCGA)数据库中膀胱癌及癌旁正常组织转录组数据及临床病理资料,下载免疫信息学数据库(Immunomes Project,ImmPort)中免疫基因数据,筛选差异表达免疫基因;采用单因素、多因素Cox风险回归模型分析并构建差异表达免疫基因预后评估模型。进一步分析免疫基因预后评估模型风险评分、临床病理特征与膀胱癌预后的相关性。结果基于R语言