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16S rRNA作为研究系统进化的生物大分子极受重视,是系统分类中必不可少的一个指标.然而,在进行系统发育分析时通常的序列联配方法有明显的局限性,即无法摆脱一级结构的束缚.20世纪80年代以来,一些研究者把目光投向了16S rRNA二级结构的分析研究,并且已经取得了相当不错的进展.研究表明,16S rRNA二级结构可能作为一个新的分类指标,成为系统分类的一个重要补充.