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以富士苹果和山定子为试材对苹果属植物ＲＡＰＤ分析的最佳反应条件及其可重复性等进行了研究，结果表明，ＲＡＰＤ反应的的各个条件因子，包括模板ＤＮＡ浓度，引物浓度ｄＮＴＰ浓度，ＤＮＡ聚合酶的种类和浓度ＰＣＲ扩增循环数以及反应总体等都对ＲＡＰＤ结果有影响，都有其最适用量范围，各因子在低子最适值时会导致扩增带数的减少甚至无带，高于最适值则无出现带的弥散或缺失，苹果属植物ＲＡＰＤ分析最适反应条件为３５～５０μ