多发性硬化症患者外周血T细胞中差异表达基因及信号通路的生物信息学分析

来源 :中国老年学杂志 | 被引量 : 0次 | 上传用户:wuyi101
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目的探讨多发性硬化症(MS)患者外周血T细胞中发生差异变化的致病相关基因及关键通路。方法首先,从GEO数据库下载了GEO数据系列GSE43591,GSE13732,GSE32988,包含了42例T细胞实验样本和35例健康对照样本的基因芯片数据;其次,在R软件中使用limma包等筛选鉴定出差异表达基因(DEGs),并进行了层次聚类分析。最后,通过两两取交集,得到了77个上调DEGs和61个下调DEGs,然后采用包括DAVID、PATHER、Reactome、STRING及Cytoscape里的Reactom
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