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中关村科技园与台湾新竹科技园都是典型的政府主导构建型高新区。竹科通过“政府倡导、市场分配”模式，构建了以本土民营企业产业集群为特征的技术创新网络，成为“东亚地区最成功的硅谷”，而中关村则长期“自主创新不足”。未来中关村自主示范区建设，尤其是构建符合中国特定政治经济结构的集群创新网络，势必要从高新区纵向治理结构、横向政企资源配置以及技术创新市场机制培育三个层面进行变革。