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综述了微生物脱有机硫在模型化合物选择、菌株选育和脱硫酶纯化与表征领域的研究进展，探讨了脱硫机理和增溶作用的应用，介绍了一种过程开发的概念工艺流程。提出了在分子水平制备嗜硫微生物或提取高脱硫活性酶、优化工艺流程和设计具有良好混合特性的反应器、开发有效的分离技术以及脱硫与煤和石油其它深加工技术接口等研究方向。