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期刊论文
迷向周期和方法在β-簪结构折褶模拟中的应用
迷向周期和方法在β-簪结构折褶模拟中的应用
来源 :南京工业大学学报:自然科学版 | 被引量 : 0次 | 上传用户:Guihuaxuetu
【摘 要】
:
采用新近提出的迷向周期和方法(IPS),结合自导Lang evin动态模拟,模拟研究9-余肽折褶成β-箨结构的情况,表明了该结构与NMR观察到的基本一致,而Ewald模拟由于是强烈的镜像相互作用
【作 者】
:
吴雄武
Bernard
R.Brooks
【机 构】
:
美国国家健康研究院心血肺研究所
【出 处】
:
南京工业大学学报:自然科学版
【发表日期】
:
2006年1期
【关键词】
:
β-簪结构
分子动态模拟
肽折褶
溶剂化
迷向周期和
长程作用
β-hairpin
molecular dynamics simulation
pepti
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采用新近提出的迷向周期和方法(IPS),结合自导Lang evin动态模拟,模拟研究9-余肽折褶成β-箨结构的情况,表明了该结构与NMR观察到的基本一致,而Ewald模拟由于是强烈的镜像相互作用会产生构型偏差,获得致密构型的几率增大,表明IPS方法更适合于周期边界条件的模拟。
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