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科技创新实践中，上海建科院结合企业的战略规划和所处环境，科技创新工作始终牢牢把握三个方向：一是围绕重大社会需求和重大工程开展科技攻关；二是为院持续发展不断科技创新，提高综合技术水平和市场竞争能力；三是把握建设科技发展趋势，开展代表发展方向和水平的前瞻性研究，保持技术领先和发展后劲。“十五”期间，通过科技创新战略的实施和持续强有力的科技投入，上海建科院的重点发展领域成果累累，新兴技术领域不断开拓、整体科技研发能力不断提高，走上了科技推动产业发展的良性轨道。