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宝天曼自然保护区分布有国家级珍稀濒危植物18种，占河南省现有国家重点保护植物总数的45.0%，其中杂木林中二级保护植物5种，三级保护植物13种.河南省级重点保护植物 10种.其区系组成以华南热带成分、华中亚热带成分和西南亚热带成分为主，在这些种类中，有些是有重要科学价值的古老残余种，如银杏、延龄草、山白树、杜仲、领春木等；有些是我国特有的珍贵药材，如天麻、杜仲、狭叶瓶尔小草等；有些是珍贵的用材树种，如大果青木千、水曲柳等；有些则是我国遗传育种的种质资源，如野大豆.