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利用Fourier乘积谱（Fourier product spectrum，FPS）系统计算了76个蛋白质亚家族的疏水自由能（Hφ）序列、电子离子相互作用势（electronion interaction potential，EIIP）序列和结构拓扑指数（Balaban指数）序列的特征周期；讨论了特征周期的规律；并以时间周期谱（time periodicity spectrum,TPS）演示了如何定位特征周期在蛋白质序列上的热区。结果表明EIIP特征周期热区与蛋白质结合位点有较好的对应关系。