SCOP数据库蛋白质折叠类型的自动分类分析

• 作 者: 张业晓 李晓琴
• 机 构: 北京工业大学生命科学与生物工程学院
• 出 处: 生物信息学
• 发表日期: 2017年2期
• 关键词: 折叠设计合理 模板数据库 分类方法 Classification of folding type Template database Method of c
• 基金项目: 国家自然科学基金（21173014）, 北京市自然科学基金（4112010）

蛋白质折叠规律研究是生命科学领域重要的前沿课题之一,蛋白质折叠类型分类是折叠规律研究的基础。本研究以SCOP数据库的蛋白质折叠类型分类为基础、以Astral SCOPe 2.05数据库中相似性小于40%的α、β、α＋β及α/β类所属的折叠类型为研究对象,完成了989种蛋白质折叠类型的模板构建并形成模板数据库;基于折叠类型设计模板建立了蛋白质折叠类型分类方法,实现了SCOP数据库蛋白质折叠类型的自动化分类。家族模板自洽性检验与独立性检验所得的敏感性、特异性以及MCC的平均值分别为：95.00%、99.99%