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2010年6月18日,中国科学院、福建省人民政府和福州市人民政府正式签约共建中国科学院海西研究院。2011年4月27日,依托海西研究院,中科院海西育成中心正式成立。2014年3月,海西育成中心被科技部认定为国家技术转移示范机构。2014年底,海西育成中心被福建省科技厅认定为＂福建省省级科技企业孵化器＂。成立之初,海西育成中心就确定了＂小中心、大网络＂的建设思路。