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本文从投入产出角度构建了北京市轨道交通运行效率评价指标体系,并在此基础上运用DEA模型,分别从综合技术效率、纯技术效率、规模效率和规模报酬四个方面对北京市在2000年~2014年间的轨道交通运行效率进行纵向评价,同时对处于非DEA有效的决策单元进行投影分析。结果表明：2004年、2005年、2007年、2009年~2012年和2014年北京市轨道交通运行效率相对较低,其投入资源存在不同程度的冗余,以及现有产出还有提升的空间。