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本文对我国登革2型病毒04株（以下简称D2-04）结构蛋白C、PrM、M基因的核苷酸序列及氨基酸序列进行了分析。结果表明结构蛋白C、PrM和M基因分别由342、273和225个核苷酸所组成，其相应的氨基酸数分别为114、91和75。从5′端起始C→PrM→M全长840个核苷酸，编码氨基酸总数为280。将D2-04株病毒结构蛋白C、PrM和M基因的核苷酸序列及氨基酸序列同几内亚C株进行比较，发现D2-04株与几内亚C株基本类似，结构蛋白C、 PrM和M核苷酸序列的类似性分别为92.7%、94.7%和92.9%，氨基酸的类似性分别为94.8%、91.3%和92.0%。三种蛋白之间的比较，在核苷酸水平上蛋白PrM的类似性大于C和M，M和C蛋白基本类似。在氨基酸水平上，C蛋白氨基酸序列的类似性大于PrM和M，PrM的氨基酸类似性小于其核苷酸的类似，这是由变化的核苷酸在三联密码中的位置所决定的。