【摘 要】
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目的:分析新型冠状病毒Omicron变异株实验室检测方法和临床特征，实现新型冠状病毒变异株快速鉴别和诊断。方法:应用荧光聚合酶链反应（PCR）法对长沙市第一医院2021年12月16日至2022年1月5日境外输入的80例核酸检测者进行新型冠状病毒核酸和突变基因检测，同时做全基因组测序验证，并收集其中鉴定为Omicron突变类型的22份样本患者的临床特征数据。结果:荧光PCR法检出Omicron变异株的特异度达100%（58/58），阳性预测值达100%（21/21），敏感度为95.5%（21/22），阴性预
【机 构】
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长沙市第一医院检验科，长沙 410005;长沙市第一医院感染科，长沙 410005
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目的:分析新型冠状病毒Omicron变异株实验室检测方法和临床特征，实现新型冠状病毒变异株快速鉴别和诊断。方法:应用荧光聚合酶链反应（PCR）法对长沙市第一医院2021年12月16日至2022年1月5日境外输入的80例核酸检测者进行新型冠状病毒核酸和突变基因检测，同时做全基因组测序验证，并收集其中鉴定为Omicron突变类型的22份样本患者的临床特征数据。结果:荧光PCR法检出Omicron变异株的特异度达100%（58/58），阳性预测值达100%（21/21），敏感度为95.5%（21/22），阴性预测值为98.3%（58/59）。测序验证发现Omicron变异株病毒基因组约存在45~50个核苷酸突变位点，S基因上约存在25~30个氨基酸突变位点。临床资料显示临床分型以轻型（59.1%，13/22）为主，无重型和危重型，临床分型与年龄呈正相关（ρ=0.698，n P<0.001），临床分型与基础疾病呈正相关（ρ=0.636，n P<0.001）。n 结论:Omicron感染者临床分型以轻型为主，年龄和基础疾病与临床分型呈正相关，早期可有AST/ALT升高。通过荧光PCR检测技术可实现对新型冠状病毒Omicron变异株的快速筛查。“,”Objective:To analyze the laboratory detection methods and clinical characteristics of patients with 2019-nCoV Omicron variant infection, to realize the rapid identification and diagnosis of 2019-nCoV Omicron variants.Methods:Totally 80 overseas patients in First Hospital of Changsha from December 16 in 2021 to January 5 in 2022 were selected, the nucleic acids and mutant genes were detected by fluorescent PCR and genome sequencing, and the clinical characteristics of patients with 2019-nCoV Omicron variant infection were analyzed.Results:The specificity was 100% (58/58) and positive predictive value was 100% (21/21) respectively, the sensitivity was 95.5% (21/22), negative predictive value was 98.3% (58/59) by detected with fluorescent PCR. It was found that there were 45-50 nucleotide displacement sites in the genome and 25-30 amino acid mutation sites in S gene fragment by genome sequencing. Clinical analysis showed that mild cases were 59.1% (13/22) in layouts, without severe and critical cases. Ages were positively associated with the clinical classification (ρ=0.698,n P<0.001), foundation infections were positively associated with the clinical classification (ρ=0.636,n P<0.001).n Conclusions:Patients with 2019-nCoV Omicron variant infection had a high viral load and long negative conversion time of nucleic acid. Ages and foundation infections were positively associated with the clinical classification. AST/ALT was higher in the early stage of the disease. Fluorescent PCR method can be used in rapid screening patients with 2019-nCoV Omicron variant infection.
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