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遗传学和分子生物学已成功地运用在家畜和玉米中.相对于家畜和玉米,遗传学和分子生物学在水产养殖中的应用要晚得多.然而,鱼类的繁殖性能和高繁殖力使它成为遗传操作的理想模型.在水产养殖的遗传改良上,有许多传统和现代的方法,选育、杂交、染色体和基因操作、性别控制、性翻转是在水产养殖中已被证明的遗传学和分子生物学技术.更现代的分子标记技术已被用来描绘鱼类基因图谱,并且用来表示育种计划中特定的数量性状.