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耐药结核分枝杆菌是困扰结核病临床治疗的难题。结核分枝杆菌全基因组测序技术可以全方位分析导致耐药的基因突变。随着测序平台和快速分析软件的发展,全基因组测序逐渐成为指导临床用药的有力工具,但是对临床样本进行直接测序进而获得耐药谱仍然面临诸多挑战。本文对结核分枝杆菌DNA提取以及痰液处理方案做一综述,并建议制定一套标准、高效的结核分枝杆菌DNA提取规范。