肝脏缺血再灌注损伤的ceRNA网络构建和潜在治疗药物筛选

来源 :中国普通外科杂志 | 被引量 : 0次 | 上传用户:hjlcd
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背景与目的:肝脏缺血-再灌注(I/R)损伤是肝移植和肝切除手术过程中常涉及的共同病理生理变化.竞争性内源性RNA(ceRNA)调控网络可参与多种疾病的发生发展.然而ceRNA网络在肝脏I/R损伤中的功能仅有少量报道.本研究旨在应用生物信息学方法构建与肝脏I/R损伤相关的ceRNA网络,同时基于差异表达基因筛选潜在治疗药物.方法:从GEO数据库获取肝脏I/R损伤的mRNA及miRNA表达芯片数据.使用R语言中的limma包进行基因差异表达分析,并使用ggplot2包进行散点图、火山图和热图绘制.使用String数据库及Cytoscape软件进行蛋白互作(PPI)网络构建.利用Metascape数据库对筛选出的差异mRNA进行GO/KEGG功能富集分析.通过转录调控网络数据库分析可能调控这些差异基因的转录因子.使用miRTarBase数据库构建miRNA-差异表达基因网络.通过starBase:ceRNA数据库构建ceRNA网络.使用比较毒物基因组学数据库(CTD)筛选对关键差异基因表达具有潜在作用的天然药物.结果:从GEO数据库获得2个肝脏I/R损伤mRNA数据集(GSE10654和GSE117066)和1个肝脏I/R损伤miRNA数据集(GSE72315).通过limma包及Venn图分析mRNA表达数据集,筛选到16个在I/R组上调表达,在缺血后适应(IPO)组下调表达的基因;7个在I/R组下调表达,在IPO组上调表达的基因.GO/KEGG功能富集分析结果显示差异基因主要参细胞死亡的正调控及对细胞外刺激反应的生物学过 程,并参与MAPK信号通路.转录调控网络数据库分析获得6个转录因子(Trp53、Cebpb、Crebbp,Fos、Nfkb1及SP1)可能参与这些差异基因的调控.通过miRTarBase数据库分析,并结合GSE72315数据集中miRNA在I/R损伤后的差异表达,获得两个可能在肝脏I/R损伤中发挥重要的作用miRNA-mRNA轴(mmu-miR-32-5p-Btg2与 mmu-miR-9-5p-Mt2).通过 starBase:ceRNA 数据库分析,最终获得9条 ceRNA网络,分别是:XIST/MEG8/LINC00963/MALAT1-miR-32-5p-Btg2轴、XIST/NEAT1-miR-132-3p-Btg2轴及HSPA9P1/RALGAPA1P1/RPS26P39-miR-9-5p-Dusp6轴.CTD数据库筛选到7种植物药(槲皮素、白藜芦醇、染料木黄酮、香豆雌酚、姜黄素、辣椒素及东莨菪碱)可降低关键基因的表达发挥潜在治疗作用.结论:通过生物信息学方法筛选了肝脏I/R损伤过程中的关键ceRNA网络及治疗的潜在天然药物,为进一步研究肝脏I/R损伤的发病机制及治疗药物提供重要依据.
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全反式维甲酸(ATRA)也叫做视黄酸、维生素甲酸,是维生素A主要的生物活性形式,迄今为止ATRA在急性早幼粒细胞白血病(APL)中的应用已超过20年,并仍为APL治疗的标准方案。随着研究的不断深入,ATRA被广泛应用于甲状腺癌、肺癌、胃癌、卡波西氏肉瘤、卵巢癌、膀胱癌、神经母细胞瘤,等肿瘤的治疗中,且正逐步延伸至更多肿瘤的分化治疗。ATRA通过与核维甲酸受体(RAR)或维甲类X受体(RXR)结合并作用于维甲酸反应原件(RARE)从而调节基因的表达,在维持细胞稳态、调节细胞周期、信号转导、转录和翻译、调控肿
目的:观察甲泼尼龙琥珀酸钠联合阿奇霉素治疗大叶性肺炎患儿的效果。方法:选取162例大叶性肺炎患儿为研究对象,采用随机数字表法分为对照组和观察组各81例。对照组采用阿奇霉素治疗,观察组在对照组基础上联合甲泼尼龙琥珀酸钠治疗。比较两组临床症状消失时间、治疗前后炎性指标水平和不良反应发生率。结果:观察组退热时间和咳喘、肺部啰音消失时间均短于对照组,差异有统计学意义(P<0.05);治疗后,观察组C反应蛋白、降钙素原水平均低于对照组,差异有统计学意义(P<0.05);两组不良反应发生率比较,差异无统计
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背景与目的:肝脏血管平滑肌脂肪瘤(HAML)是肝脏少见的一种间叶组织来源的良性肿瘤,影像学检查缺乏特异性,术前诊断率低,容易误诊为肝细胞癌或其他肝良性肿瘤,本文报告19例HAML患者的诊治过程,以期为临床提供参考和借鉴。方法:回顾性分析2011年1月—2019年12月收治的19例HAML患者临床资料,其中女12例,男7例;年龄2861岁;体检发现无临床症状者14例,表现为上腹部隐痛者3例,间断腹胀者1例,腹痛伴腹泻者1例;1例合并慢性乙型病毒性肝炎及肺脓肿,1例合并乙型肝炎肝硬化代偿期。19例均不伴肾肺等
目的:比较X线检查与螺旋CT检查在实质脏器损伤和空腔脏器损伤诊断中的效能。方法:选取96例急性胸腹部创伤患者作为研究对象,分别行X线检查和螺旋CT检查,以手术结果作为诊断金标准,比较两种检查方式对实质脏器损伤和空腔脏器损伤的诊断效能。结果:96例患者中,经手术诊断实质脏器损伤39例,空腔脏器损伤57例;螺旋CT检查对实质脏器损伤和空腔脏器损伤的诊断准确度、敏感度及特异度均高于X线检查,差异有统计学意义(P<0.05)。结论:螺旋CT检查在实质脏器损伤和空腔脏器损伤诊断中的效能高于X线。
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目的:观察参松养心胶囊联合美托洛尔治疗室性早搏患者的效果。方法:回顾性分析2019年8月至2020年8月台前县马楼中心镇卫生院收治的84例室性早搏患者的临床资料,按治疗方案不同分为对照组和观察组各42例。对照组采用美托洛尔治疗,观察组采用参松养心胶囊联合美托洛尔治疗。比较两组疗效、治疗前后室性早搏发作频率、心功能指标水平和不良反应发生率。结果:观察组治疗总有效率为90.48%(38/42),高于对照组的66.67%(28/42),差异有统计学意义(P<0.05);治疗后,观察组LVESD、LVEDD
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目的以文献计量学为基础,应用CiteSpace软件对国内外疾病家庭主要照顾者负担领域的研究特点及热点问题进行分析,为深入开展该领域研究提供参考。方法在Web of Science和中国知网(CNKI)数据库中以“照顾者负担”为主题词检索相关文献,从发文量、期刊来源、高频关键词、关键词聚类等方面进行文献计量分析。结果国内外该领域研究总体呈上升趋势,且国内研究高度集中在护理领域,照顾者负担研究热点主要聚焦于照顾者负担现状与应对策略、照顾者负担影响因素、照顾者负担构成与测量评估、照顾者负担与相关变量的关系这
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