【摘 要】
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以罗氏沼虾转录组数据为数据来源,通过研究罗氏沼虾转录组的密码子使用参数(如有效密码子的数量和相关密码子碱基的具体组成信息等),并且采用Codon W 1.4.4深入开展了统计和
【机 构】
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遗传育种研究室/农业农村部淡水渔业健康养殖重点实验室/浙江省淡水水产遗传育种重点实验室/浙江省淡水水产研究所
【基金项目】
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国家重点研发计划“蓝色粮仓科技创新”专项(2018YFD0901303),浙江省农业(水产)新品种选育重大科技专项(2016C02055-2)
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以罗氏沼虾转录组数据为数据来源,通过研究罗氏沼虾转录组的密码子使用参数(如有效密码子的数量和相关密码子碱基的具体组成信息等),并且采用Codon W 1.4.4深入开展了统计和计算.研究结果显示,同义密码子第三位核苷酸和表达基因密码子GC含量均值分别为0.40和0.45.从整体上看,ENC的平均值等于52.72,其中绝大部分的ENC值小于35.采用高频密码子的研究方法获得GAU、GAA、UUU、AAU、CCA等5个高频密码子.通过最优码子分析法确定16个最优密码子,编码10个氨基酸,最优密码子除UUG外均
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