一种优化的胡杨高效多重（12重）SSR体系

• 作 者: 徐放 赵舒 邬荣领 杜芳
• 机 构: 北京林业大学计算生物学中心、林木遗传育种国家工程实验室、生物科学与技术学院
• 出 处: 植物分类与资源学报
• 发表日期: 2014年3期
• 关键词: 胡杨 多重PCR 基因分型 Multiplex SSR Populus euphratica Genotyping
• 基金项目: Doctoral Program of Higher Education of China （ 2011DD 14120014 ） and Fundamental Research Funds for the Central Universities （TD 2012-01） to FKD

微卫星多重PCR方法是一种非常经济并且高通量的基因分型技术。本研究在耐干旱、盐碱的胡杨（Populus euphratica）中开发出一套荧光标记的12重微卫星工作体系。该体系包含12条表达序列标签微卫星（EST-SSR）引物，其中3条设计于NCBI，另外9条设计于二代的转录组序列。利用该多重微卫星体系可在单一的PCR反应体系中成功扩增出12条表达序列标签的微卫星短序列片段。并在胡杨的3个自然居群96个个体中对该体系进行了验证，结果显示该体系具有很高的稳定性及多样性。同时，在杨属的5个派7个种中对其通用性