【摘 要】
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菠菜为典型的雌雄异株植物,少数植株表现为雌雄同株。为了挖掘控制菠菜雌雄同株的基因位点,对82份菠菜高代自交系的性型进行调查分析,同时进行测序深度为10×的重测序。重测
【机 构】
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湖南农业大学园艺园林学院; 中国农业科学院蔬菜花卉研究所;
【基金项目】
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中国农业科学院科技创新工程项目(CAAS-ASTIP-IVFCAAS);中国农业科学院基本科研业务费项目(1610102018004);国家自然科学基金项目(31872102);北京市科技计划项目(Z171100001517014);国家重点研发计划项目(2018YFD0100805);农业部园艺作物生物学与种质创制重点实验室项目
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菠菜为典型的雌雄异株植物,少数植株表现为雌雄同株。为了挖掘控制菠菜雌雄同株的基因位点,对82份菠菜高代自交系的性型进行调查分析,同时进行测序深度为10×的重测序。重测序共获得了3 420 496个SNP,过滤后得到1 621 970个多态性高的SNP位点。利用高质量的SNP对菠菜雌雄同株的性状进行了全基因组关联分析(GWAS)。利用压缩混合线性模型(compress mixed linear model,cMLM)在菠菜4号染色体上检测到1个强关联区域。基于强关联信号SNP位点LD值(31.2kb)的大小,将控制菠菜雌雄同株的基因X~m定位在64.6kb的区间内。该范围内存在3个基因:Spo24600、Spo24601和Spo24602。该研究在关联区域内开发了KASP标记,可以有效用于菠菜雌雄同株的鉴定。
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