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重新感染（Reinfection）是指尿路感染经抗菌药治疗菌尿阴转后，另外一种与前次感染不同的致病菌，再次入侵尿路，引起感染。复发（Relapse）则是治疗后菌尿一度消失，在停止治疗后4～6周内由同一细菌引起再发，菌尿再出现。女性复发患者往往有肾盂肾炎，男性常有尿路异常、肾内病灶、或前列腺炎等潜在病因。重新感染病例再次出现症状时常在停止治疗后6周以上。对于反复尿路感染的病人，有时需要对尿培养所得细菌（如大肠杆菌）进行血清分型，如每次培养所得的细菌都属于同一血清型，则可证实为真正的复发。复发表明治疗上的失败，应努力找寻失败的原因，给予针对性的处理；而重新感染仅表明患者身体对尿路感染的防御能力差，并不意味着治疗失败。复发者多是肾感染，而重新感染者多为膀胱炎。