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哮喘是一种临床表现很明显但却具有多变病因的综合征，同其他慢性疾病相比，感染性疾病在哮喘发病机制中的作用一直存在争议，已经发现，病毒在慢性哮喘状态的发病机制中起一定的作用，并且是哮喘加重的原因之一，而典型的细菌在其中可能作用较小，越来越多的研究报道了哮喘和不典型病原体之间的关联，特别是肺炎支原体和肺炎衣原体，一些研究已经表明抗微生物治疗对某些哮喘病人是有益的。这到底是由于抗生素的作用还是抗炎的作用或是兼而有之目前还不得而知，与这些研究相反，近来的工作表明早期儿童时代的感染可能实际上会防止日后哮喘状态的出现，