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目的探讨含氮大环内酯免疫抑制剂FK506等不同产生菌之间进化关系及其次级代谢产物合成基因的水平转移。方法克隆不同产生菌的16SrRNA基因以及FK506等代谢产物羟化酶、甲基转移酶基因，采用Mega程序应用不同模型构建菌株系统进化树和合成酶分子进化树。结果代谢产物结构差异越大，其合成酶基因的进化关系越远，但是其产生菌的进化关系却可能较为接近，产生菌的进化关系与代谢产物合成酶分子进化关系不同步。结论此类次级代谢产物合成基因并不是菌株本身固有的，而是在菌株进化过程中同属不同种微生物之间发生基因水平转移获得的。