免疫相关LncRNA与膀胱癌预后关系分析及预测模型建立

• 作 者: 王尧 周旻 柳子川 游华
• 机 构: 广州医科大学附属肿瘤医院内科
• 出 处: 遵义医科大学学报
• 发表日期: 2020年1期
• 关键词: 膀胱癌 LncRNA 免疫治疗 基因表达谱 预测模型 bladder cancerLncRNAimmunotherapygene expression prof
• 基金项目: 国家自然科学基金资助项目(NO:81802723)

目的分析免疫相关LncRNA与膀胱癌预后的关系,建立预测模型并初步探讨各组免疫特征。方法从TCGA数据库下载393例膀胱癌患者的基因表达谱及相应预后信息,通过R和Perl软件分析处理数据并提取免疫相关LncRNA;应用COX风险比例回归模型分析预后相关LncRNA并在此基础上构建预测模型,采用Kaplan-Meier法绘制生存曲线并对组间差异进行log-rank检验;通过ROC曲线下面积(AUC)评价模型的预测准确度;采用主成分分析(PCA)及基因富集分析(GSEA)各组中免疫相关基因的分布,采用ESTI