基于HRM技术的大白菜InDel标记高效检测技术构建及其应用

• 作 者: 张志刚 司立英 赵智中 王荣花 王立华 李巧云 刘栓桃
• 机 构: 山东省农业科学院蔬菜花卉研究所/国家蔬菜改良中心山东分中心/山东省设施蔬菜生物学重点实验室,聊城市东昌府区农业局
• 出 处: 山东农业科学
• 发表日期: 2018年10期
• 关键词: 大白菜 插入/缺失标记 高分辨率熔解曲线分析 高效检测技术 Chinese cabbageInDel markerHigh - resolution inchi
• 基金项目: 山东省自然科学基金项目（ZIL2015YL073）,山东省重点研发社会公益类项目（2017GNCl0124）,山东省农业科学院农业科技创新工程项目（CXGC2016A11）,山东省泰山学者计划项目（20162020）

高分辨率熔解曲线（high-resolution melting,HRM）分析技术是基于核酸小片段之间的GC含量差异而导致双链核酸解链温度差异的一门检测技术,更多地被用于特定类型的单碱基突变筛查,很少见用于插入/缺失突变的检测。本研究从前期鉴定的可以有效区分大白菜自交系He102与06-247的593对多态性InDel引物中筛选到271对特异性好、呈共显性分布的InDel引物,采用软件TMUtility＿1.5预测了差异目标片段的熔解温度（Tm）值,发现63对标记的Tm差值满足HRM分型的灵敏度（差值绝对