【摘 要】
：
目的 通过生物信息学方法探究类风湿关节炎患者的滑膜成纤维细胞差异表达基因及相关信号通路,寻找潜在的类风湿关节炎特异性分子标志物.方法 利用R语言li咖a包等程序方法分析
【机 构】
：
新疆维吾尔自治区人民医院高血压诊疗研究中心,乌鲁木齐,830000
论文部分内容阅读
目的 通过生物信息学方法探究类风湿关节炎患者的滑膜成纤维细胞差异表达基因及相关信号通路,寻找潜在的类风湿关节炎特异性分子标志物.方法 利用R语言li咖a包等程序方法分析基因芯片GSE21959并筛选差异基因(differentially expressed genes,DEGs),利用DAVID数据库分析DEGs获得其GO富集分析和KEGG信号通路分析的结果.利用STRING数据库构建蛋白互作网络,再将结果导入Cytoscape软件中模块化核心基因并绘制蛋白互作网络图.结果 筛选获得了123个差异基因,其中表达上调的基因38个,表达下调的基因85个.GO富集分析表明DEGs主要参与了趋化因子调节、CXCR趋化因子受体结合和血管生成正向调控等生物学过程,KEGG信号通路富集分析主要包括了趋化因子信号通路、Rap1信号通路和血管平滑肌收缩等信号通路.模块化分析获得了7个核心基因分别为:CXCL1、CXCL8、CXCL6、ADRA2A、ADCY8、S1PR1和SAA1.结论 通过生物信息学分析获得类风湿关节炎的DEGs、核心基因、生物学过程和信号通路等信息,为探究类风湿关节炎的发病机制、发现诊断标志物和探索新治疗靶点提供理论依据与新的方向.
其他文献
从美国东北名城波士顿驱车,沿查尔斯河而行,或者乘坐地铁,不要十多分钟即可到达坎布里奇的哈佛广场。美国最古老和最负盛名的哈佛大学校本部即位于广场的街侧。哈佛校园占地
自从三月五日人民日报发表了立山同志对山东省文教厅编审室所编的‘农民文化课本’的严重错误的批评以后,山东省文教厅编审室四月五日在大众日报作了初步检讨,接着,大众日报
目的 了解永康市2018年学龄前儿童的视力异常状况,为干预视力异常儿童提供依据.方法 采用美国伟伦公司“SURESIGHT”视力筛查仪对视力筛查,2018年1月至2018年12月期间在我院
本文对火电厂设备状态检修进行了论述。文章指出。实施状态检修不但能达到延长设备检修周期、控制检修项目、压缩检修时间、优化工序组合、降低检修负荷的目的，而且可以使管理
本文对火电机组制粉系统运行优化方法进行了研究。文章提出了一种基于遗传算法的中储式制粉系统运行优化方法，通过遗传机理在有效参数调整范围内搜索系统运行的最优值,使用FOR
肿瘤患者甲状腺激素(T3)的代谢会产生异常,在肿瘤浸润深、淋巴结受累多、分期晚、病情重的患者中T3会显著下降.同时肿瘤的治疗(手术、放疗、化疗、靶向治疗、免疫治疗)也会造
目的 观察睾丸显微取精术在非梗阻性无精子症患者中的临床应用及其结局.方法 1 7例患者在配偶同步促排卵取卵前一天行睾丸显微切开取精术,获得精子患者行卵胞浆内单精子显微
8月,中国进出口同比增速超预期回升;继续保持进口同比增速快于出口同比增速的总体格局;1-8月累计实现的贸易顺差继续收窄
In August, the year-on-year growth rate of Chin
目的 观察薄型子宫内膜患者使用粒细胞集落刺激因子宫腔灌注后内膜形态、厚度的变化,分析在冻融胚胎移植周期中薄型子宫内膜患者使用粒细胞集落刺激因子宫腔灌注后胚胎种植率
目的 通过对小儿类风湿关节炎全基因组基因拷贝数变异(copy number variations,CNVs)的研究,为该病易感基因筛选和发病机制研究提供理论基础.方法 选取小儿类风湿关节炎患者(