小麦条锈菌产孢转录组分析

来源 :山西农业科学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:xuq
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为研究不同毒力小麦条锈菌侵染过程中基因表达差异,通过RNA-seq测定其转录组并分析差异表达基因。结果表明,每个小麦条锈菌转录组文库产生8000万~9000万条读长,其中,至少71.15%的读长可以比对到参考基因组。将读长转换计算出FPKM值并比较多个基因表达水平,FPKM值小于15的基因数分别占对应文库的79.17%、79.24%、80.01%和79.41%,FPKM值大于60的基因数所占比例均低于7.0%,而FPKM值大于10000的基因在CY31、CY32、CY33和V26菌系样品文库中分别有7、8
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