基于基因分型技术的燕麦SNP标记研究

• 作 者: 董艳辉 刘龙龙 温鑫 于宇凤 杨方 刘根科 崔林 曹秋芬 秦
• 机 构: 山西省农业科学院生物技术研究中心,山西省农业科学院农作物品种资源研究所,山西省农业科学院农业科技信息研究所,山西省农业科学院右玉农业试验站
• 出 处: 华北农学报
• 发表日期: 2019年1期
• 关键词: 燕麦 基因分型技术 抗旱 基因型 SNP Oats GBS Drought tolerance Genotype SNP
• 基金项目: 山西省重点研发(社会发展)项目(201703D321024),山西省农科院重点项目(YZD1508),山西省农科院种业专项(2016zyzx51),国家燕麦荞麦产业技术体系(CARS-07-A2).

为加快燕麦分子辅助育种进程,以1981-1983年进行抗旱性鉴定的42份燕麦种质(18份低抗、13份中抗、11份高抗)和12个未鉴定的燕麦育成品种为试验材料,采用PstⅠ/MspⅠ双酶切的dd-GBS基因分型技术构建燕麦简化基因组参考序列,通过Stacks、主成分分析、Fisher Test和Blast分析研究燕麦SNP分子标记。测序结果表明,燕麦个体的高质量reads数在4 111 218~19 019 296,利用Stacks软件成功组装753 325条燕麦简化基因组参考序列,共注释74 657个群体