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【背景】表型可塑性在生物界普遍存在,但在微生物领域的研究相对较少,利用分子标记技术来研究微生物表型可塑性方法也鲜有报道。【目的】用一株大肠埃希菌与45株金黄色葡萄球菌混合培养营造竞争环境,测定其生长量并与相同起始浓度单独培养的金黄色葡萄球菌生长量做GWAS对比,得到显著SNP位点。分析SNP位点中与金黄色葡萄球菌生长变化相关的基因表达量变化情况,研究其与金黄色葡萄球菌表型可塑性的关联性。【方法】以45株金黄色葡萄球菌在两种模式下生长量及全基因组测序结果为基础,利用双变量全基因组关联分析(Genome-wide association study,GWAS)法筛选与金黄色葡萄球菌生长量显著相的单核苷酸多态性(Single nucleotide polymorphism,SNP)位点,定位这些SNP位点对应的金黄色葡萄球菌基因,从这些基因的功能中筛选与金黄色葡萄球菌生长变化相关的部分并汇总分析。之后选取其中关联性较强的scd A基因序列为模板设计引物,用实时荧光定量PCR(Real-time quantitative PCR,q PCR)的相对定量法,选用16srDNA为内参基因,测定两种培养环境下基因的m RNA相对表达量,统计分析差异性。【结果】与大肠埃希菌混合培养的金黄色葡萄球菌受其影响生长量显著降低。GWAS在12个取样点共检测出415个显著SNP位点,筛选后对scd A基因两种培养条件下的相对表达量进行测量并统计分析,结果显示无论251050位点碱基为A或G,scd A基因在混合培养中的相对表达量都要显著高于单独培养中的表达量。【结论】测序结果表明整个培养过程中scd A基因型保持不变,而两种培养环境下金黄色葡萄球菌scd A基因相对表达量的变化反映了表型的差异。为了应对环境压力,金黄色葡萄球菌SNP251050对应的scd A基因在混合培养环境下显著提高了表达量,以维持自身在培养体系中的稳定性。这表明金黄色葡萄球菌能够依据环境变化在广义生理表型方面主动做出对环境信号的多样性响应,也可认为是金黄色葡萄球菌表型可塑性在环境变化下的反映。