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当今高职基础医学课程推行“以系统、器官为核心”的教学方式存在下列相干问题：（1）对“以问题为中心”、“以器官、系统为核心”和“活学活用为要素”具体理念的模糊认识以及该理念内化的不到位：（2）高职基础医学课程的精品课程建设没有形成整体、集团和互动的关联优势；（3）存在“砍学时”的误区，课时补偿机制不完善；（4）对学生理解能力存在“机械主义”认识的误区。