ASPP2基因启动子区DNA甲基化及转录因子DNA结合位点的干湿研究

• 作 者: 孙倩 王进科
• 机 构: 东南大学生物电子学国家重点实验室
• 出 处: 生物医学工程研究
• 发表日期: 2010年4期
• 关键词: 基因启动子区 DNA甲基化 转录因子结合位点 DNA结合 Region Transcription Factor DNA Methylation Studies

对p53凋亡刺激蛋白2(ASPP2)基因启动子区进行了甲基化及转录因子结合位点(TFBS)的生物信息学分析及实验研究。结果表明,在该基因近端启动子区存在一个长1391bp的CpG岛,且此区域中包含19个转录因子的37个结合位点,其中有13个转录因子的结合位点含有CpG;甲基化预测发现在含CpG的23个TFBS中有18个位点的CpG易发生甲基化。由此推断ASPP2是典型的多因子调控的CpG岛基因,CpG岛的异常甲基化将影响转录因子结合,导致ASPP2基因表达下调。通过对人肝癌细胞株HepG和人成纤维细胞HF