【摘 要】
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目的研制肺炎克雷伯菌(KP)全基因组DNA芯片并对芯片质量进行评价。方法根据KP的NTUH-K2044全基因组序列,挑选出5075条基因,PCR扩增各基因并纯化产物,点样制备芯片。设计了3个
【机 构】
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重庆医科大学公共卫生与管理学院,军事医学科学院微生物流行病研究所病原微生物生物安全国家重点实验室,
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目的研制肺炎克雷伯菌(KP)全基因组DNA芯片并对芯片质量进行评价。方法根据KP的NTUH-K2044全基因组序列,挑选出5075条基因,PCR扩增各基因并纯化产物,点样制备芯片。设计了3个质控杂交组合,采用双色荧光杂交策略,对芯片质量进行评价。结果与结论芯片杂交结果与理论预期结果一致。本研究成功研制了KP全基因组DNA芯片,并建立了基于全基因组DNA芯片的KP比较基因组学技术平台。
Objective To develop a whole genome DNA chip of Klebsiella pneumoniae (KP) and evaluate its quality. Methods According to the complete genomic sequence of NTUH-K2044 in KP, 5075 genes were selected, and the genes were amplified by PCR and purified. Three control hybridization combinations were designed, and the two-color fluorescence hybridization strategy was used to evaluate the quality of the chips. Results and Conclusion The result of chip hybridization is consistent with the expected results of the theory. In this study, KP genome-wide DNA microarray was successfully developed, and KP comparative genomics platform based on whole genome DNA chip was established.
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