深圳某引种奶牛场奶牛感染隐孢子虫的分子特征

来源 :中国寄生虫学与寄生虫病杂志 | 被引量 : 0次 | 上传用户:chengjiangjie
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目的 了解深圳市某奶牛场引进育种奶牛的隐孢子虫感染情况及隐孢子虫分离株的分子特性.方法 于2018年5月收集深圳市某奶牛场奶牛新鲜粪样,粪样分装后抽提隐孢子虫基因组DNA,巢式PCR扩增隐孢子虫小亚单位核糖体核糖核酸基因(SSUrDNA),阳性样品进行测序和BLAST比对分析,鉴定隐孢子虫基因型,并构建系统进化树.采用Graphad Prism7.0软件进行作图和卡方检验.结果 共收集20头奶牛粪样,其中成年产乳牛粪样5份,断奶后犊牛粪样10份,断奶前犊牛粪样5份.检出隐孢子虫阳性8份,阳性率为40%;其中成年产乳牛隐孢子虫阳性1份(1/5),断奶后犊牛隐孢子虫阳性5份(5/10),断奶前犊牛隐孢子虫阳性2份(2/5).测序分析鉴定出2个隐孢子虫基因型,芮氏隐孢子虫(n = 5)和牛隐孢子虫(n = 3),各年龄组中均有芮氏隐孢子虫感染.经与GenBank中隐孢子虫SSU rDNA基因型比对,5个芮氏隐孢子虫分离株中4个与埃塞俄比亚牛源芮氏隐孢子虫SSUrDNA基因(GenBank登录号为KT922233)序列相似度达100%,1个与华北地区牛源芮氏隐孢子虫SSU rDNA基因(GenBank登录号为HQ179574)序列相似度达99.9%;3个牛隐孢子虫分离株与埃塞俄比亚牛源牛隐孢子虫SSU rDNA基因(GenBank登录号为KT922231)的序列相似度达100%.基于SSU rDNA基因序列构建的隐孢子虫种系发育进化树,本研究获得的芮氏隐孢子虫序列与牛隐孢子虫分别在两群分支中,与不同地区的同一隐孢子虫虫种一致.结论 深圳市某奶牛场奶牛感染隐孢子虫较为普遍,以芮氏隐孢子虫为优势感染虫种.
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