华支睾吸虫组织蛋白酶D样天冬氨酸蛋白酶全长基因的生物信息学分析

• 作 者: 胡凤玉 赵俊红 胡旭初 徐劲 余新炳
• 机 构: 广州市第八人民医院传染病研究所,中山大学中山医学院寄生虫教研室
• 出 处: 南华大学学报(医学版)
• 发表日期: 2009年1期
• 关键词: 华支睾吸虫 组织蛋白酶D 天冬氨酸蛋白酶 生物信息学 Clonorchis sinensis cathepsin D aspartic protease

目的从华支睾吸虫成虫全长cDNA质粒文库中识别组织蛋白酶D样天冬氨酸蛋白酶基因，利用生物信息学方法预测其结构和功能特征，为进一步的实验研究提供理论指导。方法利用生物信息学网站的在线分析工具和Vector NTI suite软件包，识别华支睾吸虫组织蛋白酶D样天冬氨酸蛋白酶基因，并预测其编码蛋白质的各种结构特征与功能特征，并根据该基因构建种系分子进化树。结果BLASTx分析该基因为全长基因，该基因全长1,459bp，编码425个氨基酸，具有两个天冬氨酸蛋白酶的催化位点。SignalP分析该基因编码的蛋白质含