福州市柯萨奇A6型流行情况及VP1区基因特征分析

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目的了解福州市柯萨奇病毒A6型(Cox A6)的流行情况及VP1区基因特征及种系进化分布。方法采集临床诊断为手足口病患者的咽试子或肛拭子标本,通过real-time PCR法选取部分重症患者柯萨奇病毒A6型阳性标本,采用RD细胞分离病毒,RT-PCR扩增VP1基因片段并测序,利用DNAStar和Mega 5. 1软件进行核苷酸和氨基酸同源性分析并构建亲缘进化树。结果检出的3 237份肠道病毒阳性样本中,肠道病毒71型(EV71)、柯萨奇病毒A组16型(Cox A16)、Cox A6的阳性率分别为22. 0%、14. 4%、23. 9%,不同肠道病毒阳性率差异有统计学意义(P <0. 05)。福州市CVA6型分离株的核苷酸和氨基酸同源性分别为96. 3%~100%和97. 4%~100%,与原型株CV-A6/Gdula的同源性分别为81. 6%~83. 5%和94. 1%~95. 7%。进化树的分析结果显示,福州市Cox A6分离株属于D基因型。结论 Cox A6是引起福州市手足口病的主要病原体之一,本次分离得到的Cox A6病毒株均属于D基因型。
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